Limbah B3 dapat menyebabkan keracunan, kanker, penyakit degeneratif, dan bahkan kematian.
Limbah B3 dapat mencemari air, tanah, dan udara. Pencemaran air oleh limbah B3 dapat menyebabkan kematian ikan dan tumbuhan air, serta dapat menyebabkan penyakit bagi manusia yang mengkonsumsi air tersebut. Pencemaran tanah karena limbah B3 dapat merusak kesuburan tanah, serta dapat menyebabkan penyakit bagi tanaman yang ditanam di tanah tersebut. Pencemaran udara dari limbah B3 ini dapat menyebabkan gangguan pernapasan, kanker, dan banyak penyakit lainnya.